Lo lógico hubiese sido que jugase la «Série B» en el 2000, pero debido a equipo del Gama no aceptó su descenso, debido al Caso Sandro Hiroshi que acabó salvando Botafogo e Internacional del descenso, se creó la Copa João Havelange, campeonato que sustituiría al Campeonato Brasileño en el año 2000. Como el torneo era dirigido por el Clube dos 13, Fluminense como uno de los equipos fundadores, acabó ingresando al Módulo Azul, camisetas futbol argentino junto con los príncipes equipos del fútbol brasileño.